Фамилия Близниченко — типичное украинское отчество второго порядка, построенное по цепочке: Близний → Близнич → Близниченко. Если перевести на русский лад, то Близниченко — это «внук Близнего», а точнее — сын некоего Близнича, который сам был сыном человека по прозвищу Близний. Такая модель образования с суффиксом -енко широко распространена на Левобережной Украине и в Поднепровье и указывает на происхождение рода из этих земель.

Основа фамилии — прозвище Близний, которое напрямую связано с украинским словом «близнюк» (близнец). Скорее всего, прозвище закрепилось за человеком, который сам был одним из близнецов, либо за отцом, у которого родились двойняшки. В украинской традиции такие прозвища давали по заметной семейной черте — появление на свет двух детей одновременно всегда было событием, которое бросалось в глаза соседям и запоминалось.

Интересно, что в отличие от русских фамилий на -ов/-ев (Близнецов), украинская форма на -енко сохранила более архаичную отческую модель. Близниченко — это не просто указание на близнеца, а целая родословная линия, зашитая в одном слове: дед Близний, его сын Близнич и внук, который пошёл уже как Близниченко.

Изначально прозвище Близний могло употребляться параллельно с крестильным именем, но со временем, как это часто бывало в казацкой среде, полностью вытеснило официальное имя и в быту, и в документах. В реестрах Войска Запорожского встречаются похожие прозвища, что косвенно подтверждает возможную связь носителей фамилии с казачьим сословием.