Фамилия Блюмкина происходит от имени или прозвища Блюмка. В основе лежит слово «цветок»: либо идишское blume (отсюда женское имя Блума), либо немецкое Blume. В первом случае имя Блюмка — народная форма имени Блума, которым родители нарекали дочь, желая ей расти прекрасной, как цветок. Чередование у/ю в корне — результат естественных языковых процессов. Во втором случае прозвище Блюмка могло указывать на профессию: цветовода или торговца цветами. Обе версии правдоподобны, и разграничить их без точных сведений о конкретной семье сложно: для еврейской среды органичны оба пути — и от женского имени, и от занятия.

Сама модель образования фамилии — через суффикс -ин к основе Блюмк- — типична для русской и украинской традиции. Однако у ашкеназских евреев фамилии чаще оформлялись иначе: формантами -сон/-зон («сын»), -ман («человек»), -кинд («ребёнок»), -ер. Поэтому фамилия Блюмкина с русским суффиксом -ин — редкий случай, который говорит о том, что её носители жили в среде, где фамилии адаптировались под местные модели словообразования, скорее всего, на территории Российской империи. Для сравнения: горские евреи Кавказа использовали грузинский суффикс -швили («дитя»), а в Израиле фамилии нередко получали еврейские суффиксы -ис/-ес или приставку бен-.

Самый известный носитель фамилии — Яков Григорьевич Блюмкин (1900–1929), революционер, советский разведчик и один из создателей разведывательных служб СССР. Его биография не связана с цветами, но фамилия осталась в истории благодаря его бурной судьбе.