Фамилия Бобет — редкая и неочевидная для русского уха. На первый взгляд она напоминает фамилии с тюркским корнем (ср. Бобо, Бобоев), но её окончание -ет подсказывает иное происхождение. В русской фамильной системе суффикс -ет нехарактерен: обычно фамилии оканчиваются на -ов, -ин, -ский. Поэтому Бобет — почти наверняка не исконно русская, а заимствованная или искусственная.

Самая вероятная версия: фамилия восходит к французскому или немецкому прозвищу. Во французском языке bobet (произносится «бобэ») означает «простак», «глуповатый человек» — слово из диалектов, родственное bobe («глупость»). В немецком существует фамилия Bobeth, которая могла попасть в Россию с переселенцами из Германии или Прибалтики. В таком случае Бобет — это русифицированная форма немецкой фамилии, где конечное -th при записи упростили до -т.

Вторая версия, менее распространённая: фамилия могла возникнуть в среде польской шляхты или еврейского населения. В польском bobet иногда называли бобовое растение, но это скорее прозвище по роду занятий. У евреев Восточной Европы фамилия Bobet могла быть сокращением от отчества Бен-Овсег или просто звукоподражательной.

Географически носители фамилии Бобет встречаются в основном на юге России, в Краснодарском крае и Ростовской области — зонах активного переселения немецких колонистов в XVIII–XIX веках. Встречается она и среди потомков обрусевших французов, но таких случаев единицы.

Из-за редкости фамилии её этимология остаётся спорной. Но две вещи можно сказать уверенно: основа Боб- не связана с русским «боб» (фамилии Бобов и Бобет образованы по-разному), а суффикс -ет указывает на иностранный источник, который при записи адаптировали к русскому произношению.