Фамилия Бобохин — редкая и неочевидная. На первый взгляд она напоминает множество русских фамилий на -ин, образованных от прозвищ или имён, оканчивающихся на -а/-я (Бобоха → Бобохин). Но здесь есть нюанс: основа «бобох-» не встречается в древнерусских именословах и не связана с распространёнными прозвищами. Самая вероятная версия — что в основе лежит диалектный глагол или звукоподражание.

В русских говорах слово «бобохать» или «бобошить» означало «стучать, колотить, издавать глухой звук». Прозвище Бобоха могли дать человеку с тяжёлой походкой, громкому или неуклюжему. Вторая версия — от тюркского корня «бобо» (дед, предок) или «бабай» (старик), но тогда фамилия скорее имела бы форму Бобоев или Бобохонов, а не Бобохин. Для славянской среды такое заимствование маловероятно.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Бобохин, то есть сын или потомок Бобохи. Такая модель типична для северных и центральных областей России, но в переписях фамилия не частотна. Встречается в основном в Поволжье и на Урале — регионах, где смешивались русские говоры с местными диалектами.

Интересно, что в фамилии нет уменьшительного суффикса: если бы прозвище было Бобошка, получился бы Бобошкин. Здесь же грубоватая, «взрослая» форма Бобоха, что говорит о прозвище, а не о ласковом имени. Возможно, предок был плотником или кузнецом — тем, кто «бобохает» молотком. Но без письменных источников это лишь догадка.

Фамилия не дворянская и не купеческая — её носители, скорее всего, крестьяне или посадские люди. В дореволюционных метриках Бобохины изредка встречаются в Вятской и Пермской губерниях. В советское время фамилия почти не распространилась — сегодня в России её носят, по приблизительным подсчётам, не более нескольких сотен человек.