Фамилия Бодыков образована от прозвища Бодык. В его основе лежит якутское слово «бодык» — «сумерки». Такое прозвище мог получить человек, который часто бодрствовал ночью, либо ребёнок, родившийся в вечернее время. Это одна из версий, и она наиболее прямая, поскольку якутский язык даёт ясную мотивировку прозвищу.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе Бодык добавили русский патронимический суффикс -ов, который указывает на принадлежность («чей?» — Бодыков, то есть сын или потомок Бодыка). Такая модель типична для фамилий, возникших в среде, где русская административная традиция оформляла тюркские или местные прозвища. Поэтому Бодыков — фамилия восточного происхождения, но оформленная по русскому образцу.

Географически фамилия тяготеет к Якутии и соседним регионам Сибири, где якутский язык был распространён. Это не случайно: прозвище Бодык, скорее всего, бытовало именно в той среде, где слово «бодык» имело бытовой смысл. В других тюркских языках аналогичный корень встречается редко или имеет иное значение, что делает якутскую версию наиболее правдоподобной.

Интересно, что фамилия Бодыков не получила широкого распространения за пределами Сибири. Это указывает на её локальный характер: предки носителей фамилии, вероятно, жили оседло в одном регионе, и фамилия не «разошлась» по стране в ходе массовых миграций. Сословно носители могли быть как крестьянами, так и казаками — точных данных нет, но якутская основа прозвища говорит о бытовой, а не аристократической среде.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями, то Бодыков стоит особняком: есть фамилия Бодырев (от другого прозвища), но Бодыков — самостоятельная единица с чёткой якутской привязкой. В словарях русских фамилий (например, у Б. Унбегауна) она не упоминается, что подтверждает её региональную специфику.