Фамилия Богданченко — яркий пример украинской модели фамилий на -енко, самой распространённой на Левобережье и в Слобожанщине. Суффикс -енко исходно означал «маленький», «сын» или «ученик», то есть Богданченко — это буквально «маленький Богдан» или «сын Богдана». Такая модель сложилась в XV–XVII веках и стала массовым способом фиксации родства: если отца звали Богдан, его дети автоматически получали прозвание Богданченко, которое потом закрепилось как наследственная фамилия.

Основа фамилии — каноническое имя Богдан, которое на Руси появилось как калька с греческого Феодор (Теодор) — «дар Божий». Интересно, что имя Богдан долго не признавалось церковью: его давали в быту, минуя святцы, поэтому в метриках человека могли записать как Феодора, а в обиходе звать Богданом. Эта двойственность породила множество однокоренных фамилий: Богданов, Богданович, Богдашов, и, конечно, Богданченко.

Географически фамилия плотнее всего сидит в Черниговской, Полтавской и Харьковской областях — именно там в XVII–XVIII веках казацкая старшина и крестьяне массово обзаводились фамилиями на -енко. В Российской империи после отмены крепостного права Богданченко могли получить и бывшие крепостные, которых записывали по имени отца без всякой сословной привязки.

Стоит отметить, что фамилия могла возникнуть и от прозвища Богданченко, которое давали человеку, рождённому в день Бога (то есть на крупный церковный праздник), но эта версия менее вероятна: прозвища с уменьшительным суффиксом -енко редко становились самостоятельными — обычно они как раз и указывали на отцовство.

В написании фамилии путаницы почти не бывает: буква «н» в корне твёрдая, суффикс -енко не меняется. Вариант Богданченко с двумя «н» (Богданнченко) — ошибка, возникшая под влиянием русских фамилий на -ин (типа Богданин), но для украинской модели это нетипично.