Фамилия Боголюбскя — редкий случай, где написание почти наверняка искажено. В русском языке нормативной формой была бы Боголюбская. Окончание -скя вместо -ская выдает либо описку в документе, либо запись фамилии на слух в местности, где «акают» и редуцируют гласные. Человек с такой фамилией в паспорте — носитель уникального варианта, возникшего из-за ошибки писаря или сознательного упрощения.

Основа фамилии — топоним Боголюбово. Это древнее село под Владимиром, известное по летописям с XII века как резиденция князя Андрея Боголюбского. Название села и княжеского прозвища восходит к церковнославянскому «боголюбивый» — любящий Бога. Фамилии на -ский/-цкой в XVIII–XIX веках часто давали выпускникам духовных семинарий. Семинарист мог получить фамилию Боголюбский в честь праздника или иконы, а его односельчанин, переписавший документ, случайно опустил «с» в окончании — так появилась форма Боголюбскя.

Вторая версия, менее вероятная, — что фамилия происходит от прозвища Боголюб. Так могли назвать набожного, постоянно молящегося человека. Тогда суффикс -ск- указывает на принадлежность: «сын Боголюба». Но для фамилий такого типа типичнее суффиксы -ов/-ев, поэтому семинарское происхождение выглядит убедительнее.

География фамилии узкая. Встречается она почти исключительно в центральных регионах России — Владимирской, Ивановской, Нижегородской областях. Это совпадает с зоной влияния Владимиро-Суздальского княжества, где культ Боголюбской иконы Божией Матери был особенно силен.

Сословно носители Боголюбскя — почти всегда выходцы из духовного звания или крестьяне, получившие фамилию от священника при записи в метрическую книгу. Дворянской ветви с такой фамилией не зафиксировано.

Если ваша фамилия записана именно как Боголюбскя, а не Боголюбская, — это редкий маркер местного говора или канцелярской случайности. Восстановить исходную форму несложно, но и оставлять как есть — тоже вариант: так фамилия хранит память о конкретном человеке, который когда-то продиктовал её именно так.