Фамилия Болдынюк — одна из тех, что сразу выдают украинское происхождение. Её выдает характерный суффикс -юк, который в украинской ономастике выполняет ту же роль, что и русские -ов/-ев или -ин: он указывает на родство, чаще всего «сын» или «потомок». Если разобрать фамилию по составу, корень здесь — Болдын-, а суффикс -юк. Это значит, что предок носителя фамилии носил личное прозвище или имя Болдын (или Болдыня), а его сына или внука в быту называли Болдынюком — то есть «сыном Болдына».

Главный вопрос — что означает само прозвище Болдын. Тут есть несколько версий, и самая прямая отсылает к слову «болдырь». В южнорусских и украинских говорах болдырём называли метиса, ребёнка от смешанного брака (например, русского и татарки или украинца и цыганки). Прозвище было нередким и могло закрепиться за человеком, чьё происхождение отличалось от окружающих. Вторая версия — от тюркского слова «балдыр» (подросток, юноша, а в некоторых диалектах — «глупый, неразумный»). Эта гипотеза имеет право на жизнь, учитывая, что украинские земли долго соседствовали с тюркским миром, но она менее вероятна: форма «болдырь» в славянских диалектах зафиксирована надёжнее, чем прямое заимствование тюркского слова.

Менее убедительна попытка связать фамилию с русским словом «болдырь» в значении «толстяк» или «увалень» — такое толкование встречается в любительских этимологиях, но в исторических словарях не подтверждается. Скорее всего, это вторичное переосмысление уже забытого прозвища.

Географически фамилия Болдынюк тяготеет к западным и центральным областям Украины — Волынь, Подолье, Житомирщина. В России она встречается реже, чаще всего в Краснодарском крае и Ростовской области, куда украинские крестьяне переселялись в XIX — начале XX века. В польских метриках XVIII века можно найти записи о крестьянах с фамилией Bołdyniuk — это говорит о том, что фамилия сложилась ещё в Речи Посполитой, до разделов Польши.

Среди носителей фамилии нет громких исторических фигур, вошедших в энциклопедии, — это фамилия крестьянская и мещанская, без дворянских корней. Но именно такие фамилии, как Болдынюк, ценны для генеалогов: по суффиксу и корню можно довольно точно определить регион, где жил предок, а по значению прозвища — возможно, понять, чем он отличался от соседей.