Фамилия Болхавитина — женская форма, мужской вариант — Болхавитин. В русской традиции фамилии на -ин образуются от основ, оканчивающихся на -а/-я, поэтому исходное прозвище или имя предка звучало как Болхавита. Это редкая фамилия, и её корень неочевиден на первый взгляд, что открывает простор для лингвистического разбора.

Скорее всего, основа «Болхав-» восходит к диалектному слову «болха» или «болхов». В русских говорах «болха» — это устаревшее название блохи (сравните с украинским «блоха» и белорусским «блыха»). Переход «блох-» в «болх-» мог произойти из-за аканья (произношения «о» как «а») или под влиянием местных говоров, где звук «л» отвердел. Тогда Болхавита — человек, которого прозвали Блохой за маленький рост, юркость или назойливость. Такие прозвища по насекомым встречаются в русской ономастике: Блохин, Клопов, Жуков.

Есть и вторая версия, географическая. Фамилия могла возникнуть от названия города Болхов (Орловская область) или села Болховское. Жители таких мест получали прозвища Болховитин, Болховец, а форма Болхавитин — результат местного произношения (аканье: Болхов → Болхав). Суффикс -итин в этом случае указывает на принадлежность к местности: так образовывались фамилии от названий городов и волостей (Тверитин, Москвитин). Правда, в исторических документах чаще встречается форма Болховитинов (от фамилии известного церковного деятеля Евгения Болховитинова), а Болхавитин — более редкий вариант, закрепившийся, возможно, в одном из южнорусских регионов.

Третья, менее вероятная версия — связь с тюркским словом «болха» (буквально «рыба» или «рыбное место»), но для русской фамилии это нетипично, и подтверждений в ономастических словарях нет.

Фамилия явно недворянская: суффикс -ин и прозвищная основа типичны для крестьян и посадских людей, которые получали фамилии по уличным прозвищам или по месту выхода. Встречаемость Болхавитиных сегодня крайне низкая, основные носители живут в центральных и южных областях России, что косвенно подтверждает связь с Болховом или с южнорусскими говорами.