Фамилия Бородушкина образована от прозвища Бородушка — уменьшительной формы слова «борода». В словаре В. И. Даля зафиксировано и другое значение: «средняя часть нижней челюсти, под губами; подбородок». Прозвище указывало на внешнюю примету человека — небольшую, аккуратную бородку. Уменьшительный суффикс -ушк- здесь принципиален: он показывает, что речь шла не об окладистой бороде, а о маленькой бородушке. Такие прозвища часто давали не в насмешку, а для того, чтобы выделить характерную, но не громоздкую деталь внешности.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: основа Бородушк- плюс суффикс принадлежности -ин (в женском роде — -ина). Фамилия отвечает на вопрос «чей?» — то есть «сын (или дочь) Бородушки». В мужском варианте она писалась бы Бородушкин, женская форма Бородушкина закрепилась в обиходе как фамилия по матери или как историческая форма для женщины из этого рода.

Интересно, что фамилия Бородушкин встречается в основном в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях, где борода долго оставалась привычной деталью мужского облика и не воспринималась как нечто исключительное. В южных же губерниях, где брили бороды чаще, подобные прозвища могли давать с иронией. Но в случае с Бородушкой уменьшительная форма смягчает значение: прозвище скорее ласковое или нейтральное, чем насмешливое.

В отличие от фамилий вроде Бородин или Бородавкин, где основа указывает на крупную или неприятную черту, Бородушкин сохраняет оттенок чего-то небольшого и, возможно, даже уютного. Потомок человека по прозвищу Бородушка мог быть крестьянином, ремесленником или торговцем — сословной привязки у фамилии нет, так как прозвища по внешности давали людям любого звания.