Фамилия Борофанов — редкий случай, когда прозвищное имя, лёгшее в основу, почти полностью вытеснило из памяти исходный смысл. Разберёмся по порядку.

Словообразовательная модель прозрачна: суффикс -ов указывает на принадлежность («чей?» — Борофанов), а значит, предка звали Борофан. Это имя или прозвище — ключ к происхождению. Самая вероятная версия: Борофан — это диалектный вариант имени Прохор. В русских говорах, особенно на севере и в Сибири, звук «п» часто переходил в «б» под влиянием соседних гласных или просто в силу местного произношения. Так Прохор (из греческого «запевающий в хоре») превращался в Бороха, а затем и в Борофана. Подтверждение этой гипотезы — фамилия Борохов, которая существует и сегодня, а также более известная Прохоров.

Есть и вторая, менее распространённая версия. В некоторых говорах «борофан» могли называть борону — сельскохозяйственное орудие для рыхления почвы. Прозвище Борофан в этом случае получил бы крестьянин, который делал бороны, или человек с тяжёлым, «боронящим» характером. Однако эта гипотеза слабее: слово «борона» чаще давало фамилии Боронов, Бороздин, а форма «борофан» для орудия — редкость и, скорее всего, вторична.

Географически фамилия Борофанов встречается крайне редко. Основные очаги — Архангельская область (историческая родина северных говоров, где «п» меняли на «б») и некоторые районы Сибири, куда переселенцы принесли свой говор. В центральной России фамилия почти не встречается, что косвенно подтверждает её диалектное, северное происхождение.

Социально Борофановы, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Фамилия с суффиксом -ов — типично русская, «низовая», она не указывает на дворянское происхождение. В дореволюционных метрических книгах её носители записаны как государственные крестьяне или мещане.

Что касается известных носителей — в открытых источниках нет громких исторических фигур с этой фамилией. Это не значит, что их не было, но фамилия осталась «тихой», бытовой, что только усиливает её ценность как маркера локальной истории и народной речи.