Фамилия Боротюк образована по распространенной украинской модели с суффиксом -юк, который в буквальном смысле означает «сын» или «потомок» того, кто назван в основе. В данном случае основа — прозвище Борота. Как и в большинстве патронимических фамилий, первоначальное прозвище закрепилось за родом и со временем вытеснило прежнее родовое имя.

Само прозвище Борота имеет как минимум три возможных корня, и каждая версия рисует портрет предка по-своему.

Самое прямое объяснение — от глагола «бороться», то есть «одолевать, побеждать противника». Прозвище могли дать воину или вообще человеку с сильным, волевым характером, умеющему побеждать не только врагов, но и собственные слабости. Это одна из самых устойчивых версий, потому что глагол «бороти» (бороть) в древнерусском языке был широко употребителен.

Вторая версия отсылает к слову «борть» — дуплу с медом диких пчел. Если предок носил прозвище Борота, он мог быть бортником, то есть лесным пчеловодом. Бортничество было древним промыслом в лесах Украины и Беларуси, и такой род занятий легко мог закрепиться за человеком в качестве прозвища, а затем и фамилии. В пользу этой гипотезы говорит то, что в украинской ономастике немало фамилий, образованных от названий ремесел.

Третья версия обращается к тюркскому слову «борот» — «порох». В этом случае прозвище могло указывать либо на занятие предка (изготовление или торговля порохом), либо на его вспыльчивый, «горячий» нрав. Эта гипотеза менее вероятна, но возможна, учитывая исторические контакты украинских земель с тюркскими народами.

Какую бы из версий ни принять, суффикс -юк однозначно говорит о том, что фамилия сформировалась в среде украинского крестьянства или казачества. Она не относится к дворянским или книжным, а возникла естественным образом в быту, когда по прозвищу отца начинали называть весь его род.