Фамилия Бокотюк — редкий образец украинской модели фамилий на -юк. Суффикс -юк (наряду с -чук, -ак, -ук) в западных и центральных регионах Украины выполнял ту же роль, что русские -ов/-ев: указывал на сына, потомка или ученика того, кто назван в основе. Если основа «Бокот», то Бокотюк — буквально «маленький Бокот» или «сын Бокота».

Сложность в том, что основа «Бокот» в украинской ономастике почти не встречается как самостоятельное имя, а в русских говорах слово «бокот» имеет значение «крупный, тяжёлый предмет» или «обрубок». В украинских диалектах «бокіт» — это заливной луг, пойма. Поэтому наиболее правдоподобная версия: прозвище Бокот получил человек, живший у такого луга или владевший им. Второй вариант — прозвище дали по внешности или характеру: «бокот» как нечто массивное, неповоротливое. Третья, менее вероятная, гипотеза связывает фамилию с польским «bok» (бок) — тогда Бокотюк мог быть потомком человека с прозвищем «Бок» (например, кривобокого).

Географически фамилия тяготеет к Волыни и Ровенской области — именно там суффикс -юк наиболее типичен, и там же встречаются гидронимы и топонимы с корнем «бокот-». В России фамилия почти не распространена, что подтверждает её западноукраинское происхождение.

Социальный контекст: такие фамилии в основном носили крестьяне и казаки. Дворянских родов с окончанием на -юк в Российской империи не было — это чисто народная модель, закреплявшаяся в документах с XVII–XVIII веков. Таким образом, предки Бокотюков, скорее всего, были либо хлеборобами на пойменных землях, либо людьми с заметной внешностью, за которую и получили своё прозвище.