Фамилия Бовины (в исходной форме — Бовин) образована от имени собственного. Её основа — мирское имя Бова, которое на Руси давали детям вне зависимости от сословия: и крестьяне, и представители высшего света. Само имя Бова — литературного происхождения, восходит к тюркско-калмыцким корням. В старину была широко известна повесть «О Бове-королевиче», заимствованная из средневекового рыцарского романа о Буово д’Антоне. Этим сюжетом в детстве зачитывался Пушкин — образы повести прослеживаются в «Руслане и Людмиле».

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Бовин — «сын Бовы». Такая модель типична для русских фамилий, образованных от имён, прозвищ или названий профессий, оканчивающихся на -а или -я. В исторических документах встречаются реальные носители этого имени: Бова Семенович Воробин (середина XVI века, Рязань) и Епифаний Богданович Бова Скрипицын, сын боярский патриарха (1601 год). Оба примера из записей С. Б. Веселовского показывают, что имя Бова бытовало в разных слоях общества, включая служилых людей.

Точное место и время возникновения фамилии Бовин установить сложно — процесс формирования фамилий на Руси растянулся на несколько столетий. Однако ясно, что она относится к распространённому типу русских родовых имён, возникших из мирского прозвища или имени, и сохраняет память о литературном герое, популярном в допетровской Руси.