Фамилия Бойкман — редкий случай на русской почве. В ней нет ни типичного русского суффикса -ов, -ин или -ский, ни славянской основы. Это очевидный германизм, и разбирать её стоит не с корня, а с модели образования: основа + компонент -ман («человек» в немецком). Такие фамилии характерны для немцев-колонистов, переселявшихся в Российскую империю в XVIII–XIX веках, а также для евреев-ашкеназов, живших в черте оседлости и оформлявших фамилии по немецкому образцу.

Основа «Бойк» допускает два толкования. Первое: от немецкого «Bauke» — диалектного варианта имени Бальтазар (одно из имён волхвов, популярное у меннонитов и лютеран). Второе: от «Bock» (козёл) через промежуточную форму «Böck» — такое прозвище могли дать упрямому, бодливому или просто бородатому человеку. В немецких фамилиях Böckmann встречается часто, а «Бойкман» — это адаптированная кириллическая передача, где умлаут «ö» передали через «ой».

Географически фамилия привязана к бывшим колониям поволжских немцев и к западным губерниям — Волынской, Киевской, Херсонской. Там в метрических книгах конца XIX века фиксировались Бойкманы — в основном ремесленники, мельники и мелкие торговцы. Встречается и у еврейского населения: в записях о призыве в армию или в ревизских сказках фамилия могла писаться как Бойкманъ или Бойкманн.

Словообразовательная модель проста: основа «бойк» + суффиксоид «-ман». Никакой русской морфологии — фамилия склоняется по правилам заимствованных (как «Бойкмана», «Бойкману»), но в женском роде не изменяется. В отличие от фамилий на -ов, здесь не было перехода прозвища в отчество — фамилия сразу фиксировалась как наследственное именование, что типично для немецких и еврейских фамилий в Российской империи.

Спорных версий немного: иногда «Бойкман» пытаются связать с украинским «бійка» (драка) — мол, «драчун». Но против этого говорит суффикс -ман, нехарактерный для украинской ономастики: в украинском были бы формы вроде Бойченко или Бойко. Версия с немецким корнем — единственная, подтверждённая и типологией (массовый приток колонистов), и структурой фамилии.