Фамилия Божененкомаллаева — один из самых ярких примеров того, как русская словообразовательная модель наложилась на иноязычную основу, создав уникальную конструкцию. В ней отчётливо видны два корня: украинское или южнорусское имя Божен (уменьшительное от Богдан, то есть «Богом данный») и тюркский компонент «малла» — форма слова «малай» или «малла», что в ряде тюркских языков (например, в кумыкском, ногайском) означает «мальчик», «парень», «работник». Между ними стоит соединительная гласная «е» и суффикс «енк(о)», типичный для украинских фамилий.

Таким образом, в основе фамилии лежит составное прозвище или личное имя — Божененко Маллай. Первая часть, Божененко, — это «сын Божена» (по модели Иващенко, Петренко). Вторая часть, Маллай, могла быть индивидуальным прозвищем, например «мальчик» или «младший», либо указывать на социальный статус — батрак, подпасок. Соединение двух прозвищ в одну фамилию — явление редкое: обычно фамилии такого типа возникали, когда человека записывали по отцу и деду (Божененко) и добавляли его собственное прозвище (Маллай), а затем всё это слилось в одно слово.

Самый вероятный ареал возникновения — территории смешанного славяно-тюркского населения: Северный Кавказ (особенно Ставрополье, Дагестан, Чечня), Нижнее Поволжье или Кубань. Там украинские переселенцы веками жили рядом с кумыками, ногайцами, чеченцами, и взаимные заимствования имён и прозвищ были обычным делом. Финальный суффикс «-ева» указывает на принадлежность к роду: буквально «из дома Божененкомаллаевых».

Сословно носители такой фамилии, скорее всего, принадлежали к крестьянам или казакам — не к дворянству, не к духовенству. В документах XIX века подобные сложные фамилии почти не встречаются в ревизских сказках центральных губерний, поэтому можно предположить, что фамилия оформилась достаточно поздно, уже после отмены крепостного права, когда фиксация прозвищ стала более формальной.

В современном русском языке фамилия воспринимается как исключительно редкая. Её носители, вероятно, сохраняют память о смешанных корнях — славянском имени предка и тюркском прозвище, которое когда-то было его вторым именем.