Фамилия Боженова (в мужском варианте Боженов) ведет начало от нецерковного имени Бажен (или Божен). Это имя было чрезвычайно распространено в Древней Руси, и его смысл прямо связан с обстоятельствами появления ребенка на свет. Нарицательное значение имени — «желанный, сердечный, милый». Оно восходит к украинскому слову «бажати» — «желать». Баженом, а в народном произношении Боженом, часто называли долгожданного, вымоленного ребенка, которого родители наконец дождались.

Однако в этимологии этой фамилии есть и другой, менее очевидный поворот. По одной из гипотез, имя Божен могло иметь не славянские, а тюрко-татарские корни. В этом случае оно восходит к слову «бажа» — «свояк, муж сестры жены». Эта версия правдоподобна для южных регионов, где исторически были сильны контакты с тюркскими народами, и прозвище могло указывать на родственную связь по свойству.

Словообразовательная модель здесь простая и типичная для русских фамилий: суффикс -ов (-ев) присоединился к основе имени Божен. Этот суффикс указывает на принадлежность: Боженов — «сын Божена» или «из рода Боженовых». Важно заметить, что в этой фамилии нет суффикса -ин, который часто путают с -ов: если бы основа оканчивалась на -а (Бажа), мы бы получили фамилию Бажин, но здесь твердый согласный в конце основы дал именно -ов.

В написании фамилии есть одна особенность. Первая версия (от «желанный») предполагает корень «бож-», связанный с древнерусским «богъ» (счастье, удача). Вторая версия (от «бажати») — корень «баж-». Поэтому в старых документах можно встретить колебания: Баженов и Боженов. Фамилия Боженова — это вариант, закрепившийся с буквой «о», что иногда сбивает с толку при поиске предков, но сути не меняет.