Основой фамилии Боженюк послужило мирское имя Божен. Мирское имя Божен восходит к славянскому корню со значением «Бог, Божий, божественный». Вероятно, такое имя дали долгожданному ребёнку, появление которого воспринималось как дар свыше: таким образом, фактически Божен — это ребёнок, рождение которого, по мнению родителей, было благословлено Богом. Суффикс -юк дополнительно указывает на то, что фамилия Боженюк возникла порд украинским влиянием. Таким образом, потомок человека, обладающего именем Божен, со временем получил фамилию Боженюк.