Фамилия Брагнюк — характерный пример украинской фамилии, образованной по патронимической модели. Её основа — прозвище или имя Брагун, а суффикс -юк указывает на «малого» или «потомка»: Брагнюк буквально значит «сын Брагуна» или «маленький Брагун». Такие фамилии на -юк особенно распространены на западе Украины, в Волынской, Ровенской, Хмельницкой областях, а также среди украинцев, переселившихся в соседние белорусские и польские регионы.

Корень слова — «браг-», связанный с древним напитком брагой (сброженное питьё из солода или мёда). Прозвище Брагун, скорее всего, давали либо любителю хмельного, либо, что правдоподобнее, человеку, который варил брагу — пивовару или медовару. В старину на Руси и в Украине варка браги была домашним делом, но нередко этим промышляли и для продажи, так что прозвище могло закрепиться за ремесленником.

Встречается и более редкая версия — от имени Брага, которое могло быть сокращением от славянского имени Братислав или Брагин, но она менее убедительна, так как документальных подтверждений бытования такого имени в украинской антропонимии почти нет. Основной путь: прозвище → фамилия.

Суффикс -юк в украинской ономастике — один из самых продуктивных. Он вытеснял более старые формы на -енко в западных регионах, поэтому Брагнюк — фамилия именно западного ареала. В польских метриках и переписях XIX века встречаются записи Brahniuk, что говорит о латинизации написания при католическом делопроизводстве. В современной России фамилия редкая, её носители — потомки украинских переселенцев времён Столыпинской реформы или более поздних миграций.

Однокоренные фамилии — Брагин, Брага, Брагун — различаются географией и суффиксами. Брагин — русская фамилия на -ин, Брага — прозвище без оформления, Брагун — тоже прозвищная форма, но с экспрессивным суффиксом -ун, как у Говорун, Скакун. Брагнюк стоит особняком: суффикс -юк сразу выдаёт украинское происхождение и привязку к конкретной местности.