Фамилия Бубенщиков образована по типичной для русских фамилий модели: от прозвища с суффиксом -щик- прибавили патронимический суффикс -ов. Прозвище Бубенщик в старину имело не одно, а целых три значения. Во-первых, так называли мастера, который делал бубны — ударный музыкальный инструмент. Во-вторых, прозвище могли дать человеку, который беспрестанно болтает или неразборчиво бубнит, то есть говорит монотонно и невнятно. В-третьих, существовало и переносное, ироничное значение: Бубенщиком называли промотавшегося, разорившегося бедолагу — здесь сработала ассоциация с пустым, гремящим бубном, от которого нет толку.

Таким образом, предок современных Бубенщиковых мог быть ремесленником, работавшим с кожей и деревом, болтливым говорливым человеком или же тем, кто потерял состояние. Потомок человека с прозвищем Бубенщик со временем получил фамилию Бубенщиков. Словообразовательная цепочка проста и прозрачна: бубен → бубенщик (название профессии или прозвище по характерному признаку) → Бубенщиков. Суффикс -ов указывает на принадлежность: «сын Бубенщика». Фамилия встречается преимущественно в центральных и северных регионах России, где были распространены промыслы, связанные с изготовлением музыкальных инструментов.