Фамилия Бубис — одна из тех, где на небольшом пространстве уместилось сразу несколько версий происхождения. Разобраться, какая из них верна, непросто, но можно хотя бы понять, откуда пошло такое разночтение.

Самый очевидный путь — искать корень в прозвище Буб. Здесь сразу две лингвистические тропинки. Первая ведет в немецкий язык: слово Buobe означает «мальчик, парень». Так могли назвать молодого человека, подростка, возможно, подмастерья или слугу. Вторая тянется к литовскому глаголу būbauti — «реветь, выть». В этом случае Бубом прозвали бы плаксивого, обидчивого человека или ребенка, который часто хныкал. Обе версии правдоподобны и объясняют, как личное прозвище превратилось в фамилию с помощью типичного для литовской и славянской ономастики окончания -ис.

Третья гипотеза совсем иная. Она возводит основу к имени Буба — уменьшительной форме грузинского имени Вахтанг. Само имя Вахтанг, по распространенной этимологии, восходит к ираноязычной основе со значением «имеющий волчье тело» (от «borka» — волк и «tan» — тело). Если эта версия верна, то фамилия Бубис могла появиться в среде, где смешивались кавказские и балтийские или славянские традиции именования, или же ее принесли переселенцы с Кавказа. Впрочем, эта версия менее распространена, чем первые две.

Иногда фамилии с таким необычным звучанием пытаются объяснить через еврейскую традицию искусственных или «украшательных» фамилий. В качестве примера приводят Вейценбаум («пшеничное дерево»), Зауэрштром («кислый поток»), Левенфиш («рыба-лев»), Цигенбаум («козье дерево») или Квечман («высказываться неохотно»). Однако Бубис не похожа на эти составные конструкции — она короче, прозрачнее по форме и не содержит очевидного смыслового перевода. Скорее всего, перед нами не искусственная, а естественная фамилия, возникшая из прозвища.

Важно и то, что фамилия Бубис звучит по-литовски: суффикс -ис (как в фамилиях Буткус, Садаускас) типичен для литовской модели образования фамилий. Это делает версию о литовском корне būbauti наиболее органичной, хотя и не отменяет возможности немецкого влияния в приграничных или исторически смешанных регионах. Скорее всего, предки носителя фамилии жили на территории современной Литвы, в Беларуси или в бывшей Восточной Пруссии, где пересекались балтийские, славянские и немецкие языки.