Фамилия Бугнин — один из тех случаев, когда корень слова намертво сросся с суффиксом, и без небольшого исторического отступления не обойтись. На первый взгляд основа «бугн» кажется тёмной, но если знать, как в русских говорах менялись звуки, всё встаёт на свои места.

Скорее всего, в основе лежит слово «бугор». В диалектах и старом просторечии встречалась форма «бугно» — то же, что бугор, возвышенность. Человек, живший на бугре или получивший прозвище Бугна (например, сутулый или с заметной шишкой), становился родоначальником фамилии. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — Бугнин, то есть сын или потомок Бугни.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с глаголом «бугнуть» (гнуть, сгибать). В некоторых говорах так называли человека, который горбится, или того, кто занимался плетением корзин, гнул дуги. Однако первый вариант — от «бугор/бугно» — надёжнее: он опирается на типичную для русских фамилий модель образования от прозвищ по месту жительства или внешности.

Фамилия Бугнин встречается нечасто, но сосредоточена в основном в центральных и северных регионах России, особенно в Вологодской и Архангельской областях. Это не случайно: в северных говорах слово «бугно» в значении «холм, пригорок» сохранялось дольше, чем в литературном языке. Таким образом, предки Бугниных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми, которых прозвали по характерному признаку — жили на взгорке или сами были заметны статью.