Фамилия Буховская — женская форма фамилии Буховский, и её происхождение стоит искать в мужском варианте. Перед нами типичная фамилия на -ский, которая в русской традиции чаще всего указывала на географическое происхождение: предок мог быть выходцем из населённого пункта с названием Бухово, Бухов или Бухова. Такие топонимы встречаются в России, Украине и Беларуси — например, деревня Бухово есть в Смоленской области, а село Буховка — в Житомирской. В этом случае фамилия отвечала на вопрос «откуда родом?» и закреплялась за человеком, который переселился в другое место.

Однако есть и вторая, менее очевидная версия. Основа «бух-» могла восходить к прозвищу Бух, которое в разных говорах имело несколько значений. В южнорусских и украинских диалектах «бухать» — громко кричать, стучать или падать с шумом; так могли прозвать шумного, несдержанного человека или того, кто работал с грохотом (например, кузнеца). В северных говорах «буха» иногда означало «глухой звук» или «удар», что тоже могло стать основой для прозвища. В таком случае суффикс -овский/-евский добавлялся к прозвищу, образуя фамилию по модели «чей сын?» — то есть «сын Буха».

Фамилия Буховская не относится к числу дворянских, но и не была исключительно крестьянской. Носители могли принадлежать к духовенству или мещанству, особенно если фамилия образовывалась от названия села, где служил священник, или от прозвища, закрепившегося в ремесленной среде. Написание с «о» в корне (а не с «а», как в фамилии Бухавский) указывает на то, что исходное слово произносилось с чётким «о» — либо от названия Бухово, либо от прозвища Бух. В любом случае, фамилия достаточно редкая, и её носители, скорее всего, имели корни в западной части России или на востоке Украины.