Фамилия Бундин образована от прозвища Бунда. Скорее всего, в его основе лежит украинское слово «бунда» — «род верхней одежды». Бундой могли прозвать либо того, кто носил такую одежду, либо портного, который её шил. Эта версия выглядит самой прямой и бытовой: прозвища по предметам одежды и ремеслу — одни из самых древних и распространённых в народной ономастике.

Есть и другая гипотеза, но она менее убедительна. Согласно ей, в основе фамилии лежит слово «бунд» из идиша, означающее «союз». Сторонники этой версии предполагают, что основатель рода Бундиных отличался уживчивым, компромиссным характером. Однако такая этимология выглядит натянутой: прозвища по абстрактным понятиям вроде «союза» в крестьянской среде встречаются крайне редко, а слово «бунд» в значении «союз» не было общеупотребительным в славянской языковой среде.

Фамилия образована по стандартной русской модели с патронимическим суффиксом -ин. Он указывает на принадлежность: «чей?» — «Бундин», то есть «сын Бунды» или «потомок Бунды». Такая модель характерна для фамилий, образованных от основ на -а или -я, и в этом смысле Бундин ничем не отличается от десятков тысяч других русских фамилий, таких как Пушкин, Репин или Дружинин.

Интересно, что у фамилии есть и вариант написания — Бундын, который встречается в отдельных регионах. Это может указывать на диалектные особенности произношения или на более позднюю адаптацию фамилии в письменной традиции. В целом фамилия редкая, её носители сосредоточены в основном в центральных и южных областях России, что косвенно подтверждает связь с украинским корнем «бунда».