Фамилия Бункова — женская форма фамилии Бунков, и разобрать её стоит с конца: суффикс -ов- указывает на типичную русскую патронимическую модель («чей?» — сын Бунка). Значит, в основе лежало прозвище или нецерковное имя Бунко.

Что такое Бунко? Тут возможны два основных пути, и первый — самый прямой. В русских говорах «бункать» означало «бренчать», «стучать», а также «ворчать», «брюзжать». Человека с таким прозвищем могли назвать за манеру говорить невнятно, себе под нос, или за привычку постукивать, греметь. Второй вариант — от слова «буня», которое в некоторых диалектах значило «зазнайка», «гордец». Прозвище Бунко мог получить человек с характером — ворчливый или, наоборот, важный. Есть и третья, менее вероятная версия: связь со словом «бункер» в значении «закром», «ларь для зерна», но она натянута — фамилия возникла раньше, чем это слово вошло в обиход.

По географии фамилия Бунков (а значит, и Бункова) встречается не повсеместно, а тяготеет к северо-западу и центру России. В писцовых книгах XVI–XVII веков можно найти крестьян и посадских людей с прозвищем Бунко в новгородских и тверских землях. Это подтверждает, что фамилия не дворянская, а скорее крестьянская или мещанская по происхождению.

Обратите внимание на редкость суффикса -к- в основе (Бунк-о, а не, скажем, Бун-я). Такая форма характерна для кратких обиходных имён, которые в быту заменяли полное крестильное имя. Полного аналога среди канонических имён у Бунка нет — это чисто мирское, диалектное прозвище, что делает фамилию ценной для лингвистов: она сохранила местное слово, почти вышедшее из употребления.

Если сравнивать с однокоренными фамилиями — Бунин, Буняков, Бунаков, — то Бункова стоит особняком: у неё более «твёрдый» звуковой облик и явная связь с глаголом действия, а не с именем собственным. Встречаются также варианты написания с одной «н» (Букова), но это уже другая фамилия, от слова «бук».