Фамилия Чагарин — один из тех случаев, когда очевидный корень ведёт скорее к прозвищу, чем к профессии. В её основе лежит слово «чага» — так в русских говорах, особенно на севере и в Сибири, называли нарост на берёзе, чагу. Человек мог получить прозвище Чага за смуглую кожу, за привычку сутулиться (напоминая корявый нарост) или за то, что собирал и продавал этот гриб, использовавшийся как лекарство и для чая. Суффикс -ин указывает на принадлежность: Чагарин буквально означает «сын Чагары» или «человек из рода Чагары».

Интересно, что у слова «чага» есть и другое, более древнее значение — «рабыня, пленница» в тюркских языках (сравните с турецким «çâriye»). Однако для русской фамилии эта версия менее вероятна: прозвище «Чага» в значении «рабыня» было бы женским и вряд ли закрепилось бы за мужчиной-родоначальником. Скорее всего, мы имеем дело именно с севернорусским диалектным словом.

Фамилия довольно редкая. Географически она чаще встречается в Поволжье и на Урале, что совпадает с ареалом бытования слова «чага» в значении «берёзовый гриб». В документах XVII века можно встретить крестьян Чагариных из Пермской губернии — там сбор чаги был традиционным промыслом. Таким образом, предок носителя фамилии мог быть либо знахарем, торговавшим лекарственным сырьём, либо просто человеком, которого за внешность или характер прозвали «корявым, как чага».

В написании фамилии возможны варианты с одной «р» (Чагарин) и с двумя (Чагаррин), но второй встречается редко и, скорее всего, является ошибкой переписи. Родственные фамилии — Чагин, Чагаев, Чагов — образованы от того же корня, но с разными суффиксами, что указывает на разные региональные модели имяобразования.