Фамилия Чарченко — яркий пример восточнославянской модели фамилий на -енко. Этот суффикс, характерный прежде всего для Украины, указывает на происхождение от предка по имени или прозвищу: Чарченко буквально значит «сын Чарка» или «потомок Чарко». В основе лежит прозвище Чарко, а оно, скорее всего, связано с глаголом «чаровать» — колдовать, ворожить. Чарко — человек, которому приписывали магические способности, знахарь или просто тот, кто умел очаровывать, привораживать. В народной среде такие прозвища давали не в обиду, а как характеристику: «Чарко» мог быть и умелым рассказчиком, и лекарем, и просто хитрым человеком.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «чарка» (ковш, небольшая чаша для питья). Тогда прозвище Чарко мог получить любитель выпить или, наоборот, тот, кто изготавливал или продавал такую посуду. Однако «чарка» — слово не столь распространённое в прозвищах, как «чар» (колдовство), поэтому первая гипотеза выглядит убедительнее.

География фамилии Чарченко — преимущественно центральная и восточная Украина, а также южные области России, куда фамилия попала с переселенцами. В дореволюционных переписях она встречается в Полтавской, Харьковской и Екатеринославской губерниях. Сословно носители были в основном крестьянами или казаками — типичная среда для фамилий на -енко.

В русском языке фамилия не меняет окончания при склонении: Чарченко, Чарченко, о Чарченко. Ударение, скорее всего, падает на первый слог — Ча́рченко, хотя в некоторых говорах возможно смещение на второй. В отличие от фамилий с суффиксом -ов, которые «застыли» по роду, Чарченко остаётся неизменной и для мужчин, и для женщин.