Фамилия Чечеря звучит необычно для русского уха, и это подсказка: скорее всего, её корни не в центральной России, а на юго-западе или западе славянского мира. В основе лежит слово «чечер» или «чечера». В древнерусском и украинском языках так называли старую, засохшую траву, бурьян, а также место, поросшее кустарником и сорняками. Человек мог получить прозвище Чечеря за неопрятный вид, лохматые волосы, напоминающие сухую траву, или за то, что жил в глухом, заросшем месте.

Модель образования фамилии — бессуфиксная. Она не имеет типичных русских окончаний -ов, -ин, -ский. Такая форма характерна для украинских, белорусских и польских фамилий, где прозвище перешло в фамилию без изменений (сравните: Шевченко, Тимошенко, а также украинские фамилии на -а: Гуля, Верещака). Чечеря — это, по сути, застывшее прозвище.

Есть и вторая, менее очевидная, но лингвистически возможная версия. В некоторых говорах «чечер» означало «черт» или «нечистая сила» (ср. чешское čečertit se — скалиться, кривляться). Если так, то прозвище Чечеря могли дать человеку со странным, пугающим поведением или внешностью. Однако первая версия, связанная с травой и захолустьем, встречается в ономастических исследованиях чаще и считается более надёжной.

Географически фамилия Чечеря распространена в Беларуси, на востоке Украины (особенно в Черниговской и Сумской областях) и в прилегающих районах России, например, в Брянской и Курской областях. Это подтверждает её западнорусское происхождение. Носители фамилии — скорее всего, потомки крестьян или казаков, которым прозвище дали по месту жительства или характерной черте.

Сравнение с однокоренными фамилиями даёт дополнительную картину. Есть фамилия Чечерин (с суффиксом -ин, более привычным для русского севера) и Чечерский (с суффиксом -ский, указывающим на связь с местом). Но Чечеря стоит особняком — это прямое, неадаптированное прозвище, которое сохранило свою первоначальную форму и звучание.