Фамилия Чепилюгин — один из тех случаев, когда основа слова скрывает за собой неочевидное значение. Если отбросить типичный русский фамильный суффикс -ин, указывающий на принадлежность («чей сын?»), остаётся корень Чепилюг-. Здесь сразу заметна параллель с украинским или южнорусским говором: слово «чепель» или «чепіля» в диалектах означало «рукоятка», «черенок» или «палка». В частности, в украинском языке «чепіга» — это часть плуга, ручка, за которую держится пахарь. Соответственно, Чепилюга — это прозвище человека, либо связанного с изготовлением таких деталей, либо получившего его за долговязость или худобу (сравнение с палкой).

Модель образования фамилии типична для восточнославянской антропонимии: сначала возникло уличное прозвище Чепилюга, а затем его потомки стали Чепилюгиными. Суффикс -ин указывает на прямое родство: «Чепилюгин сын». Такая форма характерна для прозвищ, оканчивающихся на -а, -я (ср. Фомин от Фома, Ильин от Илья). Географически фамилия тяготеет к югу России и Украине — регионам, где пашенное земледелие было основным занятием, а слова «чепига», «чепель» были в ходу.

Версия о происхождении от тюркского корня (например, от «чепил» — «быстрый», «ловкий») менее вероятна. Фонетика фамилии слишком прозрачно указывает на славянскую лексику, связанную с сельскохозяйственными орудиями. К тому же, суффикс -юг- в прозвищах (ср. Костюга, Ветрюга) — характерная черта южнорусских и украинских говоров, где он придаёт слову оттенок грубоватой ласкательности или указывает на размер.

Таким образом, предок носителя фамилии Чепилюгин с высокой долей вероятности был крестьянином-землепашцем или ремесленником, делавшим плуги и сохи. Сама фамилия — не книжная, не дворянская, а народная, возникшая в среде, где прозвище по орудию труда было естественным и понятным каждому соседу.