Фамилия Чепыжко — редкий случай, когда корень почти наверняка указывает на конкретное ремесло или бытовую деталь, а не на имя или прозвище. Основа «чепыж» восходит к диалектному слову «чепыга» (или «чепега»), которое в южнорусских и украинских говорах означало рукоятку сохи, плуга, а иногда и само оглоблю. Человек, делавший такие части упряжи или работавший с ними, получал прозвище Чепыга, а его потомок — Чепыжко.

Суффикс «-ко» здесь не уменьшительно-ласкательный, а характерный для украинской и юго-западной русской ономастики патронимический формант. Он образовывал фамилии от прозвищ отца: Чепыжко — буквально «сын (или человек) Чепыги». Такая модель особенно типична для Левобережной Украины, Курской, Воронежской и Белгородской областей, где фамилии на «-ко» встречаются в разы чаще, чем в северных регионах.

В пользу именно ремесленной, а не прозвищной версии говорит и отсутствие у слова «чепыга» переносных значений (вроде «неповоротливый» или «упрямый»), которые могли бы закрепиться за человеком. Скорее всего, первый носитель фамилии был либо кузнецом, ковавшим сошники и оковывавшим рукояти, либо крестьянином, который славился умением ладить плуг.

В написании фамилии встречается вариант «Чепежко» — он отражает местное аканье или чередование «ы/и», характерное для некоторых диалектов. Но в документах и современных носителях чаще фиксируется форма через «ы», что и стоит считать нормативной. Географически фамилия остаётся локальной: основная масса Чепыжко сосредоточена в Сумской и Харьковской областях Украины, а также в приграничных районах России — в Курской и Белгородской областях.