Фамилия Чергин — одна из тех, где ясна словообразовательная модель, но неочевидна основа. Суффикс -ин указывает на принадлежность: «чей?» — чергин. Так могли назвать сына, внука или слугу человека, которого в округе звали Черга. Это либо прозвище, либо профессия, либо фамилия, образованная от названия места.

Самая вероятная версия — прозвище от диалектного слова «черга». В южнорусских и украинских говорах чергой называли очередь, череду, а также порядок следования. Человек, получивший такое прозвище, мог быть тем, кто следил за очередью, устанавливал порядок, или же родился в какой-то особой череде событий. Менее распространённое, но возможное значение — «черга» как вид загородки, ограды, или же искажённое «черег» — ряд, вереница.

Вторая версия связывает фамилию с тюркскими корнями. В тюркских языках есть слово «черга» или «чирга» — так называли вид плетёной изгороди или небольшой загон для скота. В таком случае прозвище мог получить человек, живший у такой изгороди или занимавшийся её плетением. При этом фамилия Чергин не выглядит типично тюркской (суффикс -ин скорее славянский), что говорит о её русификации: основу тюркского происхождения оформили русским патронимическим суффиксом.

Третья, самая редкая гипотеза — от имени собственного. В старых писцовых книгах встречается имя Черга, возможно, сокращение от Чернига или Черкас. Но документальных подтверждений массового бытования такого имени нет, поэтому эта версия уступает прозвищной.

Географически фамилия Чергин встречается рассеянно, но заметна в Поволжье и на Урале. В этих регионах было сильное влияние тюркских языков и одновременно активное формирование русских фамилий по модели «прозвище + -ин». Социальный состав носителей — в основном крестьяне и мещане, без привязки к дворянским родам.

Однокоренных фамилий немного: Черга, Чергинский, Черганов. Последняя, скорее всего, имеет отдельную тюркскую основу. Фамилия Чергин не слишком распространена, но её разбор показывает, как в одной фамилии могут пересекаться славянская модель образования и диалектная или иноязычная лексика.