Фамилия Чернощечкин образована от прозвища Чернощечка. Оно ведет свое начало от словосочетания «черные щеки». Вероятно, прозвище либо содержало указание на черты внешности основателя фамилии (смуглая кожа), либо на род деятельности предка (трубочист, дегтярь, чернорабочий). Кроме того, щека — это также и «узкое место реки, ущелья, долины, сжимаемое высокими скалистыми берегами или отвесными склонами; губа». Поэтому прозвище Чернощечка могло отражать особенности места жительства предка (недалеко от крутого берега, в долине и т.п.). Таким образом, потомок человека, обладающего прозвищем Чернощечка, со временем получил фамилию Чернощечкин.