Фамилия Чиконин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы разобраться, стоит в первую очередь обратить внимание на суффикс. Здесь мы видим -ин, а не -ов, что указывает на образование от существительного или прозвища, оканчивающегося на -а или -я. В основе лежит слово «Чикона» (или «Чиконя»).

Самая вероятная версия связывает фамилию с диалектным словом «чик» или «чика» — так в некоторых русских говорах называли птицу, особенно мелкую (сравните с «чижик», «чирик»). Суффикс -он(а) мог придавать слову увеличительное или пренебрежительное значение, как в «рука — рукона», «нога — ногона». Таким образом, Чикона — это прозвище человека, похожего на птичку: возможно, невысокого, подвижного, говорливого или, наоборот, щуплого и писклявого. Прозвища по птичьему признаку в русской ономастике встречаются часто (Воробьёв, Соколов, Петухов), и Чиконин вписывается в этот ряд, хоть и с более редкой основой.

Менее вероятна, но не исключена связь с личным именем. В старых русских святцах встречается редкое имя Чикон (возможно, как вариант греческого имени или местная народная форма). Если так, то Чиконин — «сын Чикона». Однако подтверждений широкого бытования такого имени нет, и версия с прозвищем выглядит предпочтительнее.

Географически фамилия тяготеет к центральным и северным областям России, где диалектные формы на -она были распространены. Встречается она и на Урале, куда переселенцы принесли свои прозвания. Интересно, что в некоторых переписях XIX века фигурирует вариант «Чиконинов» — с двойным суффиксом, что говорит о неустоявшемся написании и попытках «облагородить» фамилию по модели более частых -иновых.

Сословно предки Чикониных, скорее всего, были крестьянами или посадскими людьми. Прозвище, данное по внешнему признаку или характеру, редко встречалось у дворян, которые чаще получали фамилии по именам основателей рода или по названиям поместий. Так что носитель фамилии Чиконин может с высокой долей уверенности считать своим предком человека, которого в деревне прозвали Чиконей — за сходство с юркой пичугой.