Фамилия Чикотин — довольно редкая, и её происхождение не лежит на поверхности. Чтобы понять, откуда она взялась, стоит в первую очередь обратить внимание на суффикс. Окончание -ин указывает на «притяжательную» модель: такую фамилию давали по отцу, и в основе лежит либо личное имя, либо прозвище, оканчивающееся на -а или -я. Следовательно, корень здесь — Чикота.

Самая прямая версия связывает Чикоту с глаголом «чикать» или «чикнуть» — резать, отсекать, издавать резкий звук. В русских говорах «чикот» или «чикотка» могло означать зарубку, засечку, а иногда и мелкую щепку. Человек с прозвищем Чикота — скорее всего, тот, кто занимался мелкой работой по дереву, например, строгал лучину или делал щепные изделия. Впрочем, прозвище могло быть и ироничным: так могли назвать невысокого, юркого человека, который «чиками» передвигается.

Менее вероятная, но возможная версия — связь с диалектным словом «чикот» в значении «остаток, обрубок». В этом случае прозвище могло закрепиться за человеком невысокого роста или с каким-либо физическим недостатком (например, без пальца). Однако в ономастике прозвища по физическим недостаткам обычно более прямолинейны, а «Чикота» звучит скорее как уменьшительное, чем как описательное.

Географически фамилия Чикотин встречается крайне рассеянно, без ярко выраженного «гнезда». Это говорит о том, что она могла возникнуть в разных местах независимо — в каждой местности у своего Чикоты. Сравнение с однокоренными фамилиями (Чиков, Чикалов) показывает, что основа «чик-» была продуктивной в северных и центральных русских говорах, но единого центра происхождения у Чикотиных нет.

Таким образом, носитель фамилии Чикотин может считать своим предком человека, получившего прозвище по занятию (резчик по дереву) или по внешней особенности (шустрый, мелкий). Суффикс -ин чётко указывает, что это отчество второго порядка: сын Чикоты.