Фамилия Чилина — женская форма, мужской вариант — Чилин. Она образована по простой и распространённой модели: к основе, в данном случае «Чил-», добавили суффикс -ин, который в русских фамилиях указывает на принадлежность («чей?» — Чилин, то есть сын или потомок Чилы). Так что ключ к происхождению — прозвище или имя Чила.

Что это могло быть за слово? Самый прямой путь — от глагола «чилить». В русских говорах, особенно южных и западных, «чилить» означало «бездельничать, медлить, тянуть время». Чилой называли вялого, медлительного человека или лентяя. Прозвище нелестное, но в крестьянской среде его давали без злого умысла — по заметной черте характера. Менее вероятная, но возможная версия: от диалектного «чила» — «килька, мелкая рыбёшка». Тогда прозвище мог получить рыбак или человек маленького роста. В некоторых говорах «чила» — это ещё и «щепка, лучина», но такое толкование встречается редко.

Фамилия Чилин (и Чилина) — редкая. Она почти не встречается в старых дворянских родословных книгах, что указывает на крестьянское или мещанское происхождение. Географически её можно встретить в центральных областях России, а также на Урале, куда переселенцы приносили свои прозвища. Если отталкиваться от глагольной основы, то фамилия — типичный пример «говорящего» прозвища, которое со временем закрепилось как родовое имя.