Фамилия Чубурина — женская форма, а её мужской вариант — Чубурин. В основе лежит прозвище или нецерковное имя Чубура. Что оно означало — вопрос, на который нет одного ответа, но есть несколько версий, и каждая по-своему интересна.

Проще всего предположить связь с диалектным словом «чубура» — так в некоторых говорах называли чурбан, обрубок дерева, а также неуклюжего, неповоротливого человека. Прозвища по внешности или характеру — один из самых распространённых источников русских фамилий, и Чубура мог получить человек плотный, грузный или медлительный. Но есть и другая, более редкая возможность: в южнорусских и украинских говорах «чубура» — это разновидность казацкого чуба, длинной пряди волос, которую оставляли на бритой голове. Прозвище тогда могло относиться к человеку с заметным, характерным чубом, возможно, к запорожскому казаку или тому, кто носил такую причёску.

Суффикс -ин указывает на принадлежность: Чубурин — сын Чубуры, то есть «чей?» — Чубурин. Такая модель типична для прозвищ и имён, оканчивающихся на -а, -я. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, и её география бытования — в основном юг России, Поволжье и примыкающие к Украине области. Встречается она нечасто, что делает её любопытным объектом для локальных генеалогических изысканий.

Стоит упомянуть и редкую версию, которую иногда приводят, но без твёрдых доказательств: связь с тюркским словом «чубур» — род войлока или попона. Если это так, то прозвище могло относиться к ремесленнику, работавшему с войлоком, или к человеку, носившему такую одежду. Однако для славянской фамилии эта версия выглядит натянутой: гораздо вероятнее, что корень — исконно славянский, с тем же звукоподражательным или описательным значением, что и в словах «чурка», «чуб».

Таким образом, Чубурина — фамилия, которая скорее всего родилась из прозвища по внешнему признаку (чуб) или по характеру (неповоротливый, как чурбан). В любом случае, её носители могут с уверенностью считать, что их предок был человеком с яркой, запоминающейся чертой, за которую его и прозвали Чубурой.