Фамилия Чукарина — женская форма, а в основе лежит мужская фамилия Чукарин, которая образована по самой распространённой в русском языке модели с суффиксом -ин. Этот суффикс в древнерусской традиции указывал на принадлежность: Чукарин буквально значил «сын Чукары» или «человек из семьи Чукары». Такой способ словообразования типичен для фамилий, возникших от прозвищ или мирских имён, оканчивавшихся на -а/-я.

Корень фамилии — «чукар» — вызывает споры. Самая вероятная версия связывает его с диалектным словом «чукарый», которое в разных говорах означало «пёстрый», «рябой», «крапчатый». В старину так могли прозвать человека с рябым лицом после оспы или с необычной, пёстрой внешностью. В пользу этой версии говорит и то, что в русских говорах слово «чукарка» фиксировалось как название пёстрой курицы или коровы, а прозвища по масти животных были очень распространены.

Менее убедительна, но всё же возможна версия о тюркском происхождении основы. В некоторых тюркских языках «чукар» означало «кривой», «изогнутый» или «согнутый». Однако в случае с русскими фамилиями такое значение встречается редко, и чаще всего подобные корни переосмыслялись на русской почве в сторону «пёстрого» значения.

География фамилии Чукарин (а значит, и Чукарина) сосредоточена в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской, Тамбовской и Ростовской областях. Это косвенно подтверждает диалектный характер прозвища: именно в этих местах слово «чукарый» было в ходу.

Таким образом, предок носительницы фамилии Чукарина получил прозвище Чукара за свою рябую, пёструю внешность или — реже — за связь с пёстрой мастью скота. Фамилия недворянская, крестьянская или мещанская, что типично для прозвищ, закреплённых в качестве родового имени в XVIII–XIX веках.