Фамилия Чужакина — женская форма фамилии Чужакин, и её происхождение напрямую связано с русским словом «чужак». В отличие от большинства фамилий на -ин, которые образованы от крестильных имён или названий профессий, эта фамилия происходит от прозвища. Чужаком на Руси называли пришлого человека, не местного, того, кто не вписывался в общину — либо по происхождению, либо по поведению. Прозвище было необязательно унизительным: в среде крестьян и ремесленников чужака могли так дразнить за замкнутость, странные привычки или просто за то, что он недавно поселился в деревне.

Словообразовательная модель проста: к основе «чужак» добавили типичный русский суффикс принадлежности -ин, который указывает на «сына Чужака» или «человека из семьи Чужака». Женская форма Чужакина закрепилась в документах по отцу или мужу. Фамилия редкая, и её география неширокая: чаще всего Чужакины встречаются в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской, Тамбовской и Ростовской областях. Это объясняется тем, что в этих краях исторически оседали переселенцы из других губерний, и прозвище «чужак» было ходовым для новосёлов.

Интересно, что фамилия Чужакин (и Чужакина) стоит особняком среди однокоренных. Например, фамилия Чужеземцев звучит книжно и реже, а Чужаков — более распространённый вариант. Чужакин же отличается суффиксом -ин, который в русской ономастике чаще прикрепляется к основам на -а (ср. Бородин от Борода, Птицын от Птица). Это говорит о том, что прозвище Чужак было именно личным, а не уличным прозванием рода, и фамилия закрепилась в той форме, в какой её записал писарь при первой переписи.

Версия о том, что фамилия могла произойти от тюркского или финно-угорского корня, маловероятна: слово «чужак» — исконно русское, общеславянское, и в других языках аналогичные прозвища (например, Stranger в английских фамилиях) тоже встречаются, но не массово. Таким образом, носительницы фамилии Чужакина могут быть уверены: их предок, скорее всего, был человеком, который когда-то пришёл в новое место и остался в нём навсегда, а прозвище закрепилось за его потомками.