Фамилия Данило — одна из тех, что образована напрямую от полной формы имени, без добавления типичных русских суффиксов -ов или -ин. Её основа — имя Данило, народная и просторечная форма канонического имени Даниил. В переводе с древнееврейского «Даниэль» означает «мой судья — Бог» или «Бог — мой судья». Такая модель словообразования (бессуффиксная, или «усечённая») в русской ономастике встречается реже, чем патронимы на -ов, и чаще указывает на украинское, белорусское или южнорусское происхождение носителя.

В отличие от фамилий Данилов или Данильченко, форма Данило исторически закрепилась как неизменяемое прозвище или родовое имя. В среде запорожского казачества и в реестрах Войска Запорожского XVII века нередко фиксировали именно такие именования — по имени без суффикса, что могло означать либо прямое указание на отца (Данило — сын Данилы), либо прозвище человека, носившего это имя. Ономаст Б. Унбегаун в своём труде «Русские фамилии» относит подобные образования к группе «фамилий из полных имён», подчёркивая, что они особенно характерны для украинской традиции.

Интересна и региональная привязка: фамилия Данило компактно встречается на западе современной Украины (Волынь, Галиция) и в пограничных районах Беларуси. В польских метриках XVI–XVIII веков форма Danilo также фиксировалась как имя и фамилия, что связано с влиянием православной и греко-католической традиции именования. Таким образом, предки носителей фамилии Данило с высокой вероятностью были крестьянами или казаками, а не дворянами, — в среде шляхты такие «простые» бессуффиксные фамилии встречались реже.

Спорных версий происхождения у этой фамилии почти нет: корень прозрачен, а альтернативные толкования (например, от тюркского «даныл» — «славный») не выдерживают критики, поскольку не подтверждаются ни географией бытования, ни историческими документами. Единственное, что стоит учесть: в некоторых говорах ударение в фамилии могло падать на последний слог (Данило́), что сближает её с украинским произношением имени, а не с русским ударением на первый слог (Да́нило).