Фамилия Денекина — женская форма, а мужская, Денекин, встречается реже и звучит непривычно. В основе лежит прозвище или неканоническое имя Денека. Чтобы понять его происхождение, нужно присмотреться к суффиксу -ек-. В русских фамилиях он встречается нечасто, но вполне объясним: это уменьшительная форма от имени или прозвища на -ня, -на. Проще говоря, Денека — это «маленький Деня» или «сын Дени».

Самая вероятная версия выводит Деню из просторечной формы крестильного имени Денис (церковное Дионисий). Уменьшительные Деня, Дена, Денечка были распространены в крестьянской среде. Соответственно, Денека — дальнейшее «сжатие» имени: Деня → Денька → Денека. Фамилия образована по стандартной модели: к основе Денек- добавили суффикс принадлежности -ин, означающий «чей?» — «сын Денеки».

Менее убедительна, но возможна связь с диалектным словом «денек» — так в некоторых говорах называли денную бабочку, а в переносном смысле — легкомысленного, порхающего человека. Однако для прозвища такая основа редка, и фамилий от насекомых в русском языке гораздо меньше, чем от личных имён. Поэтому версия с Денисом надёжнее.

Географически фамилия Денекина тяготеет к центральным и южным областям России, где форма Денис была особенно популярна. Встречается она нечасто, что указывает на локальное бытование прозвища в одном-двух уездах. Сословно — почти наверняка крестьянская или мещанская: фамилии на -ин с уменьшительной основой редко встречались у дворянства.

В написании стоит обратить внимание на букву «е» после «н»: фамилия пишется через «е», а не через «ё». Это важно при поиске в архивах, так как в дореволюционных документах «е» и «ё» не различались, и фамилию могли записать как Денекина или Денёкина. Современная норма закрепила безударную «е».