Фамилия Держунин — редкая и неочевидная. На первый взгляд в ней слышится глагол «держать», и это не случайно, но связь не прямая. Основа здесь — не повелительное наклонение, а прозвище Держуня. Так могли называть человека медлительного, вялого, того, кто «держит» других, заставляет ждать. В русских говорах слово «держуня» фиксировалось именно в значении «копуша, мешкотный человек». Прозвище давалось с лёгкой насмешкой: не злой, но нерасторопный.

Модель образования проста: суффикс -ин указывает на принадлежность — «чей?» — Держунин, то есть сын или потомок Держуни. Это типичная для северных и центральных областей Руси патронимическая фамилия, возникшая из бытового прозвища, а не из крестильного имени. В отличие от фамилий на -ов/-ев, которые часто образовывались от имен на твёрдый согласный, -ин закреплялся за основами на -а/-я: Держуня → Держунин. Такая модель встречается реже, что делает фамилию более редкой и локальной.

Есть и альтернативная, менее вероятная версия. В некоторых диалектах «держать» могло означать «владеть, управлять», и Держуней могли прозвать хозяина, «держателя» чего-либо — например, постоялого двора или лавки. Но эта гипотеза слабее: прозвища от глаголов в форме первого лица (Держу, Верчу, Кручу) обычно образовывали фамилии без суффикса -ин (Держунов, Верчунов). А форма Держуня — явно прозвищная, уменьшительная, характерная для характеристики человека.

Географически фамилия тяготеет к Вятке и северо-востоку Европейской России. В переписях XVII–XVIII веков встречаются крестьяне и посадские люди с прозвищем Держуня в Слободском и Котельническом уездах. В советское время фамилия осталась малочисленной, не «расползлась» по стране. Сейчас Держунины живут в основном в Кировской области и Пермском крае, что подтверждает её локальное вятское происхождение.

Двойное «н» на конце — не ошибка, а орфографическая норма: суффикс -ин даёт одну «н», но на стыке с конечной «н» основы (Держуня → Держунин) их становится две. В XIX веке встречалось написание через одно «н» — Держунин, но современный вариант закрепился как более точный.