Фамилия Дикунова образована от прозвища Дикун. В основе прозвища лежит глагол «диковать», который в сибирских говорах означал «глядеть в испуге, в изумлении, недоумевая». Такое прозвище мог получить человек с необычным поведением: либо буйный и строптивый, либо, напротив, пугливый и дичащийся людей. Впрочем, не исключён и географический вариант: Дикуном могли называть человека, жившего на отшибе, в глухой местности.

Словообразовательная модель фамилии проста: к основе прозвища Дикун добавили суффикс -ов, а затем — родовое окончание -а, указывающее на принадлежность к женской линии. В русской традиции фамилии на -ов/-ев первоначально означали «чей?» — то есть «сын Дикуна» или «дочь Дикуна». Со временем форма Дикунова закрепилась как фамилия, передаваемая по наследству.

Фамилия встречается преимущественно в северных и сибирских регионах России, что подтверждает диалектное происхождение корня. В других славянских языках аналогов почти нет — это делает Дикунову локальной, «земляческой» фамилией, тесно связанной с историей освоения Сибири.

Сравнение с однокоренными фамилиями (Диков, Дикарев, Дикушин) показывает, что суффикс -ун в основе Дикун указывает на носителя действия или свойства: «тот, кто дикует». Такая модель типична для прозвищ, характеризующих поведение человека.