Фамилия Дийкова — женская форма, мужской вариант — Дийков. Она образована по самой распространённой в русском языке модели: от основы на согласный с помощью суффикса -ов/-ев. Вопрос в том, что лежит в основе — имя, прозвище или географическое название.

Скорее всего, корень восходит к каноническому имени Дий. Это краткая, разговорная форма от крестильного имени Дий (в святцах — Дий, Дий Антиохийский). Такое имя встречалось в русской среде, хоть и редко. От него пошли фамилии Диев, Дин, Диянов и, через вариант с суффиксом -к- (Дийко), — Дийковы. Суффикс -к- в данном случае уменьшительно-ласкательный или принадлежностный, как у тысяч других фамилий (Иван → Ивашко → Ивашков). То есть Дийко — это «маленький Дий» или «сын Дия».

Версия с прозвищем менее вероятна, но её стоит упомянуть. В южнорусских и украинских говорах «дий» могло означать «деяние», «действие» или относиться к глаголу «деть» (деть куда-то). Однако прозвище в такой форме было бы странным и плохо объяснимым, поэтому версия с именем надёжнее.

Географически фамилия редкая. Встречается в основном на юге России, в Ростовской области и Краснодарском крае, а также на Украине. Это косвенно подтверждает, что предки Дийковых могли быть выходцами из южнорусских или украинских земель, где краткие формы имён на -ко были особенно распространены.

Ударение в фамилии, скорее всего, падает на второй слог: Дийко́ва. В письменных источниках XIX века фамилию могли писать через «и» с одной «й» (Дикова), но современное написание с двумя «и» и «й» закрепилось в советских паспортных системах.