Фамилия Догонова — женская форма фамилии Догонов, которая образовалась от прозвища или нецерковного имени Догон. В основе лежит глагол «догонять» или существительное «догон» (погоня, преследование). Скорее всего, прозвище Догон давали человеку, который отличался быстротой, настойчивостью, умел догонять беглецов или зверя на охоте. В крестьянской среде такое прозвище мог получить и тот, кто постоянно опаздывал или, наоборот, был незаменим в погоне за должниками.

Суффикс -ов в мужской форме указывает на типичную русскую патронимическую модель: Догонов — сын Догона. Фамилия не относится к числу распространённых, но встречается в центральных и южных регионах России, особенно в Воронежской и Ростовской областях, где были сильны казачьи традиции. В казачьей среде прозвища, связанные с быстротой и преследованием, давали часто — это мог быть и дозорный, и ловчий.

Есть и менее вероятная версия: происхождение от тюркского слова «доган» (сокол, ястреб). В таком случае фамилия могла принадлежать человеку с татарскими корнями, а при адаптации на русской почве «доган» превратился в Догон. Однако для фамилии Догонов эта гипотеза слабая: в русских говорах «догон» — живое слово, а тюркское «доган» обычно давало фамилии Доганов, без второго «о».

Сравнение с однокоренными фамилиями — Догоняев, Догоновский — показывает, что Догонов стоит ближе всего к прямому прозвищу, без дополнительных суффиксов и усложнений. Это ставит её в ряд простых, но точных фамилий-характеристик, которые в XVI–XVII веках закреплялись за крестьянами и служилыми людьми.