Фамилия Домашников происходит от прозвища или нецерковного имени Домашник. В русском языке слово «домашник» имело несколько значений, и все они так или иначе связаны с домом. Самое распространенное — человек, который предпочитает сидеть дома, домосед. Но было и другое, более конкретное: так могли назвать работника, живущего в доме хозяина, то есть дворового слугу или прислугу. В некоторых говорах «домашником» называли и просто хозяина дома, домовитого крестьянина.

Словообразовательная модель типична для русских фамилий: к основе «Домашник» добавляется патронимический суффикс -ов, указывающий на принадлежность: «чей?» — Домашников, то есть сын или потомок Домашника. Суффикс -ник в основе характерен для прозвищ, образованных от прилагательных или существительных с помощью этого форманта (ср. Шубник, Сапожник, Дворник). Исходное слово «дом» — общеславянское, древнее.

Географически фамилия Домашников встречается в основном в центральных и северных регионах России, в частности, в Вологодской, Кировской, Нижегородской областях и в Поволжье. Это объясняется тем, что в этих местах слово «домашник» в значении «домосед» или «домовой работник» было особенно употребительно. В южных и сибирских говорах фиксируются другие варианты, например, «домушник» (с утратой -ш-), но фамилия Домашников осталась в северном произносительном варианте.

В отличие от фамилий на -ский, которые часто указывали на дворянское или духовное происхождение, Домашников —典型ная крестьянская фамилия. Она образована не от географического названия, а от бытового прозвища, что типично для основной массы русского населения до отмены крепостного права. Прозвище могло закрепиться за целым родом, и в переписных книгах XVII-XVIII веков можно встретить крестьян с таким именованием, хотя письменные фиксации редки.

Спорных версий у этой фамилии немного. Иногда её ошибочно связывают с растением «домашник» (так в некоторых областях называют подорожник или другие травы, растущие у дома), но это вторичное, народное толкование. Основная, бытовая версия — от прозвища по образу жизни или роду занятий — наиболее правдоподобна и подтверждается параллелями в других славянских языках, где слова с корнем «дом» образуют схожие прозвища.