Фамилия Дороня — редкий пример, где сразу видна словообразовательная особенность: она не встраивается в типичные русские модели на -ов, -ин или -ский. Фамилия застыла в форме, которая в русском языке обычно свойственна уменьшительно-ласкательным именам (ср. Ваня, Петя, Коля). Это даёт ключ к разгадке: перед нами, скорее всего, не искусственно созданная фамилия, а прозвище или производное личное имя, которое закрепилось за родом без добавления патронимического суффикса.

Основа «Дорон-» восходит к имени Дорофей (греч. Dorotheos — «дар божий»). В народной речи имя сокращали и переделывали: Дороня — одна из таких обиходных форм, наряду с Дорон, Дороша, Доронька. Фамилии, образованные от сокращённых имён без суффикса, характерны для украинской и белорусской традиции, где фамилии нередко заканчиваются на гласный. В русском же языке такое окончание чаще встречается у прозвищ, которые позже могли «обрусеть» через добавление -ин или -ов, но здесь этого не произошло.

Поэтому география фамилии Дороня тяготеет к западнорусским землям, Украине и Белоруссии. Встречается она и у еврейских носителей — как вариант фамилии Дорон, образованной от того же греческого корня, но в ашкеназской среде нередко через идиш.

Версия о происхождении от прозвища, связанного с глаголом «дорожить» (ценить, беречь) или с «дорогой», маловероятна: такие основы обычно дают фамилии с суффиксами (Дорогин, Дорожкин). Имя Дороня — самый прямой и лингвистически обоснованный путь. Социальный статус первых носителей, скорее всего, был крестьянским или мещанским — фамилии в такой незамысловатой форме редко встречались у дворянства.

Таким образом, фамилия Дороня — это застывшая в документах домашняя форма имени Дорофей, которую носил ваш предок. Она не перестраивалась под стандарты канцелярии, а осталась такой, какой её произносили в семье.