Фамилия Друненкова — женская форма фамилии Друненков, и её происхождение стоит искать в прозвище или имени, от которого образована основа. Словообразовательная модель здесь классическая: суффикс -ов/-ев указывает на принадлежность («чей?»), то есть Друненков — это «сын Друненка» или «человек из рода Друненка». Сама основа «Друненк-» восходит к прозвищу Друнёнок (или Друненко), которое могло означать «маленький, молодой Друн» — от слова «друн» или «друна».

В диалектах русского языка слово «друн» встречается редко, но в ряде говоров (особенно северных и смоленских) «друн» означало «оборванец, неряха» или, наоборот, «бродяга, бездельник». Впрочем, есть и более прозаичная версия: в псковских и тверских говорах «друнить» — значит «дразнить, насмехаться», так что Друном могли прозвать задиристого или острого на язык человека. Суффикс -енк- в основе (Друненко, Друнёнок) типичен для украинской и южнорусской традиции образования уменьшительных или «молодёжных» прозвищ, что указывает на возможные корни фамилии в южнорусских или малороссийских землях.

Географически фамилия Друненков (и, соответственно, Друненкова) встречается в основном в центральных и южных областях России, а также в Беларуси. В переписных книгах XVII–XVIII веков подобные прозвища фиксировались среди крестьян и однодворцев, что позволяет отнести фамилию к крестьянской среде, а не к дворянской. Альтернативная версия, связывающая фамилию с личным именем Дроний (греческого происхождения), маловероятна из-за фонетического расхождения: «Друн» от «Дроний» могло бы дать «Дронов», но не «Друненков».

Таким образом, предок носительницы фамилии Друненкова, скорее всего, получил прозвище Друнёнок за свой характер или внешний вид, а его потомки закрепили фамилию по отцу. Сегодня это редкая фамилия, сохранившая в основе живое диалектное слово, которое уже почти вышло из употребления.