Фамилия Дубнина — одна из тех, что образована не напрямую от дерева, а от женского имени или прозвища. Её основа — слово «дубня» или «дубняк» (редкий лес, дубрава), но в русской ономастике фамилии на -ин чаще всего возникали от женских имён или прозвищ. В данном случае исходным могло быть прозвище Дубня — так могли назвать коренастого, крепкого человека, похожего на дуб, или того, кто жил в дубовом лесу. Затем от этого прозвища образовали фамилию Дубнин, а от неё — женскую форму Дубнина, которая закрепилась как фамилия для женщин или как наследственная фамилия в роду.

Модель образования здесь простая: суффикс -ин (притяжательный, как в фамилиях Пушкин, Гагарин) присоединялся к основе, оканчивающейся на -а/-я. Это отличает Дубнину от фамилий на -ов (Дубнов, Дубов), которые шли от мужских имён или прозвищ с окончанием на твёрдый согласный. Встречается и вариант Дубнин — мужская форма, но в русской традиции фамилия часто фиксировалась в женском роде, если первым носителем была женщина или если документы оформляли на вдову.

Географически фамилия Дубнина рассредоточена, но заметна в центральных и южных регионах России — там, где дубовые леса были обычны: в Тульской, Орловской, Воронежской, Рязанской областях. Встречается и на Украине, где дуб — символ силы, и фамилии с корнем «дуб-» очень часты.

Интересная деталь: в старых переписных книгах XVII века встречаются крестьяне с прозвищем Дубня — например, в писцовых книгах по Рязанскому краю. Это подтверждает, что фамилия не книжная, а народная, возникшая в среде крестьян и однодворцев. Позже, при закреплении фамилий, Дубнина могла перейти и в дворянские роды, но это скорее исключение: в основном фамилия оставалась в крестьянском и мещанском сословии.

Сравните с однокоренными: Дубов, Дубков, Дубцов — все они образованы от разных форм слова «дуб». Дубнина стоит особняком за счёт суффикса -ин и женского окончания, что делает её более редкой и локальной. Если ваша фамилия Дубнина, предки, скорее всего, жили в дубовой местности и получили прозвище по силе или месту жительства.