Фамилия Дубовиковы образована от личного прозвища Дубовик. Самая прямая версия связывает его с названием гриба дубовик. Этот гриб внешне похож на белый, но отличается красной нижней стороной шляпки и синеющей на срезе мякотью. Дубовик распространён в средней полосе европейской части России, на Кавказе, изредка встречается в Сибири и на Дальнем Востоке. Отсюда логичный вывод: основатель рода мог быть грибником, хорошо знающим лес, или получить прозвище за какую-то внешнюю черту, напоминающую этот гриб.

Модель образования типична для русских фамилий: к основе «Дубовик» добавили патронимический суффикс -ов, что буквально означает «сын Дубовика». Со временем форма закрепилась и перешла в разряд наследственных фамилий.

Менее очевидная, но возможная версия связывает прозвище не с грибом, а с дубом — деревом. В русских говорах «дубовик» могли называть человека крепкого телосложения, упрямого или, наоборот, простоватого. Также «дубовиком» иногда именовали лесного духа или хозяина дубравы. В этом случае фамилия оказывается в одном ряду с такими «растительными» фамилиями, как Дубов, Дубков, Дубравин. Однако версия с грибом кажется более конкретной и потому правдоподобной: прозвища по названиям грибов (Груздев, Рыжиков, Опёнкин) в русской ономастике не редкость.

О точном месте возникновения фамилии Дубовиков говорить сложно — процесс формирования фамилий был длительным и шёл в разных регионах. Но ареал распространения самого гриба дубовика даёт примерную географическую привязку: центральные и южные области России.