Фамилия Дуднику — одна из тех, что сразу выдают свою украинскую или южнорусскую природу. Она образована не по стандартной модели с суффиксами -ов/-ев или -ин, а по характерной для украинской ономастики форме — от прозвища с помощью суффикса -ук/-юк, который в безударной позиции часто редуцируется до -у. В данном случае основа — «Дудник», а окончание -у указывает на родительный падеж, что типично для западноукраинских фамилий: буквально «чей?» — Дуднику, то есть «сын Дудника». Встречается и вариант без конечного гласного — Дудник, но форма на -у подчёркивает конкретный регион бытования, чаще всего Волынь, Подолье или Галичину.

Корень фамилии прозрачен: «дудник» — это человек, который играет на дудке, то есть музыкант-пастух или скоморох. В старой Украине и на юге России дудка была простейшим народным инструментом, и прозвище Дудник могли дать не только профессиональному музыканту, но и болтуну, пустомеле — по аналогии с «дудеть» в смысле «говорить без умолку». В словаре украинских прозвищ это слово фиксируется именно в двух значениях: музыкант и говорун.

Словообразовательная модель проста: от нарицательного «дудник» через патронимический суффикс -ук (в форме -у) возникла фамилия, указывающая на потомка. Это же прозвище могло лечь в основу фамилий Дудников, Дудниченко, Дудкин, но форма Дуднику сохранила архаичный родительный падеж, который в современном украинском языке почти исчез из фамилий, оставшись в основном в западных областях.

В историческом контексте носители фамилии Дуднику — это, скорее всего, крестьяне или казаки. Среди казацкой старшины и шляхты такие «ремесленные» фамилии встречались редко, поэтому социальный потолок предков — мещанство или свободное сельское население. Географически фамилия редкая: по данным современных переписей, она концентрируется в Тернопольской, Хмельницкой и Ровненской областях, единично — в Беларуси.

Спорных версий происхождения практически нет: корень слишком ясен, чтобы искать альтернативы вроде тюркских заимствований или личных имён. Единственное, что стоит оговорить: в русском языке фамилия склоняется как существительное мужского рода (Дуднику — Дуднику — Дудником), а в украинском — по правилам местного склонения, что иногда вызывает путаницу в документах.